Kitablar
1990, Cənubi Azərbaycanda ədəbi dil: normalar, üslublar. Bakı, Elm.
1991, Füzulidən Vaqifə qədər. Bakı: Yazıçı.
1993, Dolan, kəfkirim, dolan. Bakı: Yazıçı.
1994, Türk dili: 9 və 10-11-ci siniflər üçün dərslik/T.Hacıyev, N. Cəfərov. Bakı: Öyrətmən,1994.
1995, Azərbaycan türkcəsinin milliləşməsi tarixi. Bakı.
1996, Bəxtiyar Vahabzadə: (portret-oçerk). Bakı: Azərbaycan, 1996.
Azərbaycan dili: IX sinif üçün dərslik. Bakı: Təhsil, 1996.
1997, “Koroğlu”nun poetikası. Bakı, BUN,1997.
1998, Azərbaycan dili: 10-11-ci siniflər üçün dərslik. Bakı: Təhsil, 1998.
1998, Türk dünyası: xaos və kosmos 1998.
1999, Eposdan kitaba. Bakı, Maarif, 1999.
1999, Genezisdən tipologiyaya
2000, Azərbaycan mədəniyyəti məsələləri
2001, Azərbaycanşünaslıq məsələləri, Bakı, BUN.
2002, Heydər Əliyev, Bakı, 2002. 2 ç,s. 1000 nüsxə.
2002, Azərbaycanşünaslığa giriş. Bakı, AzAtaM.
2002, Türkiyə Atatürkün, Azərbaycan Heydər Əliyevin əsərindir –N.Cəfərov (müsahibələr).B., AzAtaM, 2002.
2003, Sössür, de Ferdinand “Ümumi dilçilik kursu”. Tərc., Bakı: BDU nəş., 2003.
2004, Qədim türk ədəbiyyatı B.,AzAtaM, 2004.
2004, Klassiklərdən müasirlərə. Bakı: Çaşıoğlu, 2004.
2004, Azərbaycan: Heydər Əliyevdən İlham Əliyevə. (Nizami Cəfərov, Dəyanət Osmanlı). 2004.
2004, Heydər Əliyev və Azərbaycan, Atatürk və Türk dünyası. Bakı: Elm,2004.
2004, İlham Əliyev. (Nizami Cəfərov, Dəyanət Osmanlı). 2004.
2005, Professor Sadıq Tural. (Nizami Cəfərov, Nazir Əhmədli). 2005.
2005, Azərbaycanşünaslığın əsasları. Bakı, Pedaqogika, 2005.
2006, Türk xalqlarının ədəbiyyatı. Qədim dövr,2006.
2007, Türk xalqlarının ədəbiyyatı (4 cilddə) .2007
2007, Nizami Cəfərov Seçilmiş əsərləri – Seçilmiş əsərləri I cild. ( 5 cilddə) Bakı. “Elm”, 2007.
2007,Nizami Cəfərov Seçilmiş əsərləri – Seçilmiş əsərləri II cild ( 5 cilddə) Bakı. “Elm”, 2007.
2007, Nizami Cəfərov Seçilmiş əsərləri – Seçilmiş əsərləri III cild ( 5 cilddə) Bakı. “Elm”, 2007.
2007, Nizami Cəfərov Seçilmiş əsərləri – Seçilmiş əsərləri IV cild. ( 5 cilddə) Bakı. “Elm”, 2007.
2007, Nizami Cəfərov Seçilmiş əsərləri – Seçilmiş əsərləri V cild. ( 5 cilddə) Bakı. “Elm”, 2007.
2008, Atatürkün Azərbaycan siyasəti. ( Nizami Cəfərov, Mehmet Akif Tural). 2008.
2008, Ədəbiyyat: Ümumtəhsil məktəblərinin 11-ci sinfi üçün dərslik. Bakı: Çaşıoğlu, 2008.
2009, Azərbaycan dili lüğət tərkibinin təkmilləşdirmə prosesinin riyazi təhlil problemləri. (Nizami Cəfərov, E.Şahbazov, İ.Niyazova) 2009.
2009, Türk dünyasının yeni lideri. (N.Cəfərov, O.Musayev, V.Osmanlı) . 2009.
2010, Nizami Cəfərov. Yunus Oğuz: Düşüncə Yazıçısı. Bakı, “Elm və təhsil”, 2010.
2010, Prof.Dr. Nizami Cəfərov . Bir dilçilinin xatirələri.
2010. Nizami Cəfərov. Vidadi Babanlı. 2010.
2011, Tarixin müasirliyi... müasirliyin tarixi. Bakı, “Elm və təhsil”, 2011.
2012, Professor Nizami Cəfərov. Zəhmətkeş alim, tanınmiş dilçi-türkoloq. Bakı. “Elm və təhsil”, 2012.
2012, Azərbaycan xalqının tarixi və ya tərcümeyi-halı. Bakı, İrfan, 2012.
2012, Ədəbiyyat: Ümumtəhsil məktəblərinin 8-ci sinfi üçün dərslik. Bakı: Xəzər, 2012.
2012, Ümumtəhsil məktəblərinin 10-cu sinfi üçün dərslik. Bakı: Çaşıoğlu, 2012.
2013, Nizami Cəfərov. Açıq məktublar. 2013.
2013, Atatürkün Azərbaycan siyasəti: (öz dili ilə) Nizami Cəfərov,Mehmet Akif Tural Atatürkün Azərbaycan siyasəti.
2013, Nizami Cəfərov. Professor Gövhər Baxşəliyeva. Bakı, AzAtaM, “Elm və təhsil”, 2013, 100 səh.
2014, Nizami Cəfərov. Hidayət. Bakı, AzAtaM, “Elm və təhsil”, 2014, 40 səh.
2014, Nizami Cəfərov: Azərbaycan xalqının tarixi və ya “tərcümeyi hal”ı (Azərbaycan və ingilis dillərində) Bakı, AzAtaM, 2014.
2014, Prof.Dr.Nizami Jafarov The history or the “autobiography” of the azerbaijan people. (İngilis dilində) Translator: İlaha Abdullayeva AzAtaM,”Nurlan”,Baku 2014.
2014, Nizami Cəfərov: Azərbaycan xalqının tarixi və ya “tərcümeyi hal”ı (Azərbaycan və ingilis dillərində) Bakı, AzAtaM, 2014.
2014, Nizami Cəfərov, Nəsibə İsrafilqızı. Mirəfsəl Təbib və qa bir şairin poetikası.
2015, Nizami Cəfərov .Gülağa Tənhanın poeziyasi. Baki. Çaşioğlu,2015,92 səh.
2015, Nizami Cəfərov. Elçin Bakı, “AzAtaM”, “Elm və təhsil”, 2015,68 səh.
2015, Nizami Cəfərov. Səməd Vurğun...Və Səmədoğlular Bakı, “AzAtaM”, “Elm və təhsil”, 2015, 160 səh.
2016, Nizami Cəfərov, Vuqar Sərdarov ,Altay Cəfərov Azərbaycançılıq ideologiyasının etnoqrafik əsasları. Bakı, “AzAtaM”, “Elm və təhsil”, 2016, 216 səh
2016, Nizami Cəfərov. Türkün dünyasından Türk dünyasına. (türkoloji etüdlər). Bakı, “AzAtam”, “Elm və təhsil”, 2016,108 səh.
2016, Nizami Cəfərov. Möhsün Nağısoylu Bakı, AzAtam,”Elm və Təhsil”, 2016, 56 səh.
2016, Nizami Cəfərov. Türkologiyaya giriş. Bakı, AzAtam,”Elm və Təhsil”, 2016, 248 səh.
2016, Nizami Jafarov. Selected artıcles. Translator: İlaha Abdullayeva Baku, AzAtam,”Science and Education”, 2016, 151 p.
2016, Nizami Cəfərov Ədəbiyyatın müstəqilliyindən müstəqilliyin ədəbiyyatına Bakı, AzAtam,”Elm və Təhsil”, 2016
2016, Nizami Cəfərov. Afaq Məsud dünyası Bakı, AzAtam,”Elm və Təhsil-1”, 2016
2016, Nizami Cəfərov. Etnoloji etüdlər. Bakı, AzAtam,”Elm və Təhsil” ,2016
2016, Nizami Cəfərov. Keçən günlərin dastanı. Bakı-2016. 216 səh.
2017, Nizami Cəfərov. Türkologiyanın müasir problemləri AzAtam, “Elm və təhsil” Bakı, 2017
2018, Nizami Cəfərov. Dolan kəfkirim, dolan. Bakı “Elm və təhsil”2018, 192 səh.
2018, Nizami Cəfərov. Ədəbiyyat söhbətləri. Bakı . 2018, 388 səh.
2018, Türkologiya. (Nizami Cəfərov, Aysel Qəribli, Emin Qəribli), Bakı, “STV-TRANS”, 2018, 292 s.
Sayı 500-dən çox olan elmi əsərlərin, o cümlədən monoqrafiyanın müəllifidir. Əsərləri Türkiyə və İranda da nəşr edilmişdir.
Metodik göstəriş və proqramlar
Azərbaycan Respublikası Təhsil Nazirliyi Elmi-Metodik Şurası “Azərbaycan dili və ədəbiyyatı” bölməsinin üzvü kimi orta ümumtəhsil məktəbləri üçün Azərbaycan dili proqramlarının, dərsliklərinin hazırlanmasında iştirak etmişdir.